Структура

Административно-управленческий персонал

1. Администрация
2. Группа кадров
3. Секретариат
4. Группа охраны труда
5. Группа гражданской обороны
6. Группа информационных технологий

Научные подразделения

Отдел патологической морфологии

1. Центральная патологоанатомическая лаборатория
2. Лаборатория иммуноморфологии воспаления
3. Лаборатория патологии репродукции
4. Лаборатория клеточной и молекулярной патологии сердечно-сосудистой системы
5. Лаборатория клинической морфологии

Отдел функциональной морфологии

1. Лаборатория нейроморфологии
2.Группа патологии терминальных состояний
3.  Лаборатория патологии клетки

Отдел эмбриологии

1. Лаборатория роста и развития
2. Лаборатория развития нервной системы
3. Лаборатория развития эндокринной системы

Лаборатория морфологии и патологии опорно-двигательного аппарата

Референс-центр инфекционной и вирусной онкопатологии

1. Группа патоморфологических и иммуногистохимических исследований
2. Группа молекулярной биологии и генетики с функциями биометрии и биомедицины и биомедицинской статистики
3. Группа электронной микроскопии

Референс-центр по оценке генетической чистоты лабораторных животных

1. Группа физиологических исследований
2. Группа молекулярной биологии и генетики
3. Группа биометрии и биомедицинской статистики

Научно-вспомогательные подразделения

1. Научно-организационный отдел
2. Учебный отдел
3. Музейно-коллекционная группа
4. Научная библиотека
5. Экспериментально-биологическая клиника подопытных животных

Вспомогательные подразделения.

1. Инженерно-техническая и административно-хозяйственная служба
2. Транспортная группа